Όρια μπαίνουν στην συνταγογράφηση των φαρμάκων 5 βασικών ασθενειών,καθώς οι γιατροί είναι πλέον υποχρεωμένοι να ενσωματώνουν σιγά σιγά  στο σύστημα της περιβόητης ηλεκτρονικής συνταγογράφησης τα θεραπευτικά πρωτόκολλα..Για το λόγο αυτό οφείλουν από εδώ και πέρα να υιοθετούν συγκεκριμένους κανόνες και φραγμούς αναφορικά με το είδος της ασθένειας στην οποία "αντιστοιχεί" το κάθε φάρμακο.